El comité de expertos es un órgano autónomo de participación académica, establecido por el Consejo de Rectores. Su misión es colaborar en los programas del Consorcio y desarrollar redes temáticas entre los cuerpos académicos de las instituciones integrantes.

Los comités están conformados por 231 académicos, uno de cada universidad por área de conocimiento. Sus integrantes han sido designados por los titulares de cada una de las IES integrantes del Consorcio. Forma parte del espacio de acción académica.

Se acordó dividir al Comité en las siguientes áreas que podrán incrementarse según lo acuerde el consejo de rectores: arquitectura, biología, contabilidad y administración, ingeniería civil, medicina, psicología y medicina veterinaria y zootecnia.